Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDRT15Q96T59 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDRT15Q96T59 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDRT15Q96T59 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms