Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCC1Q96S66 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCC1Q96S66 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCC1Q96S66 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCC1Q96S66 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLCC1Q96S66 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CLCC1Q96S66 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLCC1Q96S66 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CLCC1Q96S66 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms