Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS2Q96PQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SORCS2Q96PQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SORCS2Q96PQ0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SORCS2Q96PQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms