Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RNPC3Q96LT9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RNPC3Q96LT9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RNPC3Q96LT9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms