Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDLIM2Q96JY6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDLIM2Q96JY6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDLIM2Q96JY6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms