Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PGBD1Q96JS3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PGBD1Q96JS3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PGBD1Q96JS3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGBD1Q96JS3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms