Protein–RNA interactions for Protein: Q96G23

CERS2, Ceramide synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2Q96G23 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CERS2Q96G23 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CERS2Q96G23 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CERS2Q96G23 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CERS2Q96G23 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms