Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00526Q96FQ7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00526Q96FQ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00526Q96FQ7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms