Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HDAC7Q8WUI4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HDAC7Q8WUI4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDAC7Q8WUI4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC7Q8WUI4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms