Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB3IL1Q8TBN0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB3IL1Q8TBN0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB3IL1Q8TBN0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms