Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms