Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTD1Q8N815 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNTD1Q8N815 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTD1Q8N815 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNTD1Q8N815 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms