Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC33Q8N5R6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC33Q8N5R6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC33Q8N5R6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms