Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RHOT2Q8IXI1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RHOT2Q8IXI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RHOT2Q8IXI1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.5 ms