Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.74
PPARGC1BQ86YN6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
PPARGC1BQ86YN6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
PPARGC1BQ86YN6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PPARGC1BQ86YN6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PPARGC1BQ86YN6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PPARGC1BQ86YN6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
PPARGC1BQ86YN6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms