Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YTHDF3Q7Z739 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YTHDF3Q7Z739 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YTHDF3Q7Z739 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
YTHDF3Q7Z739 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms