Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC70Q6NSX1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC70Q6NSX1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC70Q6NSX1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC70Q6NSX1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms