Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LCN12Q6JVE5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LCN12Q6JVE5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LCN12Q6JVE5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms