Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
TNS3Q68CZ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNS3Q68CZ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNS3Q68CZ2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNS3Q68CZ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms