Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MLIPQ5VWP3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MLIPQ5VWP3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MLIPQ5VWP3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms