Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS54

PSMG4, Proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4Q5JS54 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PSMG4Q5JS54 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMG4Q5JS54 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMG4Q5JS54 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms