Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFTN2Q52LD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFTN2Q52LD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFTN2Q52LD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms