Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
MED1Q15648 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MED1Q15648 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MED1Q15648 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MED1Q15648 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MED1Q15648 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
MED1Q15648 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MED1Q15648 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MED1Q15648 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MED1Q15648 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MED1Q15648 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
MED1Q15648 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
MED1Q15648 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
MED1Q15648 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MED1Q15648 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MED1Q15648 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MED1Q15648 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MED1Q15648 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
MED1Q15648 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MED1Q15648 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MED1Q15648 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
MED1Q15648 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
MED1Q15648 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MED1Q15648 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MED1Q15648 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
MED1Q15648 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
MED1Q15648 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MED1Q15648 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MED1Q15648 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MED1Q15648 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MED1Q15648 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MED1Q15648 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
MED1Q15648 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MED1Q15648 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
MED1Q15648 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MED1Q15648 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
MED1Q15648 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MED1Q15648 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MED1Q15648 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MED1Q15648 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MED1Q15648 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
MED1Q15648 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MED1Q15648 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MED1Q15648 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MED1Q15648 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MED1Q15648 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MED1Q15648 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
MED1Q15648 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MED1Q15648 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
MED1Q15648 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MED1Q15648 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
MED1Q15648 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
MED1Q15648 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MED1Q15648 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MED1Q15648 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MED1Q15648 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MED1Q15648 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
MED1Q15648 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MED1Q15648 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MED1Q15648 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
MED1Q15648 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
MED1Q15648 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MED1Q15648 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MED1Q15648 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
MED1Q15648 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MED1Q15648 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MED1Q15648 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MED1Q15648 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
MED1Q15648 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
MED1Q15648 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
MED1Q15648 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
MED1Q15648 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MED1Q15648 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
MED1Q15648 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MED1Q15648 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
MED1Q15648 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MED1Q15648 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MED1Q15648 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MED1Q15648 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MED1Q15648 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MED1Q15648 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MED1Q15648 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MED1Q15648 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MED1Q15648 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MED1Q15648 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MED1Q15648 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MED1Q15648 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MED1Q15648 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MED1Q15648 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
MED1Q15648 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
MED1Q15648 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MED1Q15648 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MED1Q15648 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MED1Q15648 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
MED1Q15648 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MED1Q15648 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
MED1Q15648 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
MED1Q15648 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MED1Q15648 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MED1Q15648 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1187 ms