Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAPTM4AQ15012 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LAPTM4AQ15012 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LAPTM4AQ15012 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LAPTM4AQ15012 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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