Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NR1D2Q14995 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NR1D2Q14995 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NR1D2Q14995 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NR1D2Q14995 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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