Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDC1Q14676 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDC1Q14676 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDC1Q14676 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms