Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GBX1Q14549 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GBX1Q14549 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms