Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CUL4AQ13619 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CUL4AQ13619 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CUL4AQ13619 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CUL4AQ13619 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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