Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKP2Q13309 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SKP2Q13309 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKP2Q13309 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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