Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MYO1EQ12965 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYO1EQ12965 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYO1EQ12965 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYO1EQ12965 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms