Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
POLEQ07864 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
POLEQ07864 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLEQ07864 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLEQ07864 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLEQ07864 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLEQ07864 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLEQ07864 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
POLEQ07864 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLEQ07864 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLEQ07864 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLEQ07864 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
POLEQ07864 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLEQ07864 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLEQ07864 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLEQ07864 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLEQ07864 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLEQ07864 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLEQ07864 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLEQ07864 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLEQ07864 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLEQ07864 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLEQ07864 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLEQ07864 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLEQ07864 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLEQ07864 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLEQ07864 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLEQ07864 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLEQ07864 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLEQ07864 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLEQ07864 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLEQ07864 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLEQ07864 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLEQ07864 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLEQ07864 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLEQ07864 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLEQ07864 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLEQ07864 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLEQ07864 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLEQ07864 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLEQ07864 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLEQ07864 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLEQ07864 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLEQ07864 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLEQ07864 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLEQ07864 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLEQ07864 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLEQ07864 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLEQ07864 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLEQ07864 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLEQ07864 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLEQ07864 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLEQ07864 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLEQ07864 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLEQ07864 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLEQ07864 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLEQ07864 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLEQ07864 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLEQ07864 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLEQ07864 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLEQ07864 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLEQ07864 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLEQ07864 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLEQ07864 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLEQ07864 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLEQ07864 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms