Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SATB1Q01826 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB1Q01826 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SATB1Q01826 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SATB1Q01826 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms