Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCNA1P78396 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCNA1P78396 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNA1P78396 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNA1P78396 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms