Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PSMC1P62191 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PSMC1P62191 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMC1P62191 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMC1P62191 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms