Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTDSS1P48651 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTDSS1P48651 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTDSS1P48651 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTDSS1P48651 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms