Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG1BP48304 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG1BP48304 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG1BP48304 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG1BP48304 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG1BP48304 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG1BP48304 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG1BP48304 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
REG1BP48304 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
REG1BP48304 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REG1BP48304 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
REG1BP48304 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
REG1BP48304 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REG1BP48304 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
REG1BP48304 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
REG1BP48304 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REG1BP48304 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REG1BP48304 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REG1BP48304 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
REG1BP48304 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
REG1BP48304 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
REG1BP48304 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REG1BP48304 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REG1BP48304 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REG1BP48304 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REG1BP48304 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
REG1BP48304 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
REG1BP48304 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG1BP48304 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG1BP48304 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG1BP48304 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG1BP48304 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG1BP48304 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG1BP48304 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG1BP48304 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
REG1BP48304 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
REG1BP48304 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
REG1BP48304 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG1BP48304 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG1BP48304 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG1BP48304 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG1BP48304 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG1BP48304 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG1BP48304 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
REG1BP48304 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
REG1BP48304 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
REG1BP48304 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
REG1BP48304 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
REG1BP48304 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
REG1BP48304 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
REG1BP48304 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
REG1BP48304 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
REG1BP48304 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
REG1BP48304 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
REG1BP48304 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
REG1BP48304 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
REG1BP48304 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
REG1BP48304 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
REG1BP48304 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
REG1BP48304 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
REG1BP48304 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
REG1BP48304 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
REG1BP48304 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
REG1BP48304 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
REG1BP48304 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
REG1BP48304 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
REG1BP48304 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
REG1BP48304 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
REG1BP48304 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
REG1BP48304 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
REG1BP48304 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
REG1BP48304 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
REG1BP48304 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms