Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNT3P45378 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNT3P45378 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNT3P45378 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms