Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT2P35908 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT2P35908 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT2P35908 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT2P35908 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT2P35908 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT2P35908 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT2P35908 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT2P35908 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT2P35908 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT2P35908 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT2P35908 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT2P35908 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT2P35908 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KRT2P35908 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT2P35908 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT2P35908 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT2P35908 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT2P35908 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT2P35908 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT2P35908 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT2P35908 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT2P35908 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT2P35908 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT2P35908 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT2P35908 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT2P35908 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT2P35908 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT2P35908 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT2P35908 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT2P35908 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT2P35908 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT2P35908 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT2P35908 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT2P35908 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT2P35908 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KRT2P35908 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT2P35908 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT2P35908 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT2P35908 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT2P35908 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT2P35908 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT2P35908 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KRT2P35908 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT2P35908 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT2P35908 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT2P35908 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT2P35908 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT2P35908 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT2P35908 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT2P35908 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT2P35908 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT2P35908 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT2P35908 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT2P35908 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT2P35908 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT2P35908 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT2P35908 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT2P35908 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT2P35908 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT2P35908 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT2P35908 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT2P35908 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT2P35908 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT2P35908 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT2P35908 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT2P35908 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT2P35908 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT2P35908 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT2P35908 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT2P35908 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT2P35908 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT2P35908 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT2P35908 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT2P35908 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT2P35908 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT2P35908 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT2P35908 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT2P35908 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT2P35908 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT2P35908 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT2P35908 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT2P35908 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT2P35908 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT2P35908 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT2P35908 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT2P35908 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT2P35908 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT2P35908 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT2P35908 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT2P35908 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT2P35908 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms