Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5A1P25705 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5A1P25705 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP5A1P25705 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms