Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPH2P23942 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRPH2P23942 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRPH2P23942 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPH2P23942 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms