Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAX3P23760 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAX3P23760 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAX3P23760 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PAX3P23760 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX3P23760 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX3P23760 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX3P23760 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX3P23760 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX3P23760 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX3P23760 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PAX3P23760 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PAX3P23760 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAX3P23760 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAX3P23760 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAX3P23760 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PAX3P23760 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAX3P23760 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAX3P23760 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PAX3P23760 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAX3P23760 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAX3P23760 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAX3P23760 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PAX3P23760 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAX3P23760 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAX3P23760 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PAX3P23760 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAX3P23760 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAX3P23760 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAX3P23760 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PAX3P23760 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX3P23760 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX3P23760 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX3P23760 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PAX3P23760 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAX3P23760 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAX3P23760 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAX3P23760 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PAX3P23760 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAX3P23760 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAX3P23760 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PAX3P23760 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAX3P23760 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAX3P23760 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAX3P23760 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAX3P23760 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAX3P23760 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PAX3P23760 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAX3P23760 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAX3P23760 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAX3P23760 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PAX3P23760 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAX3P23760 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAX3P23760 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAX3P23760 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAX3P23760 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAX3P23760 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PAX3P23760 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAX3P23760 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAX3P23760 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAX3P23760 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAX3P23760 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PAX3P23760 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PAX3P23760 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAX3P23760 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAX3P23760 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PAX3P23760 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PAX3P23760 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PAX3P23760 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAX3P23760 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAX3P23760 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PAX3P23760 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PAX3P23760 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms