Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRM3P20309 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRM3P20309 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms