Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SDSP20132 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SDSP20132 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SDSP20132 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDSP20132 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDSP20132 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDSP20132 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SDSP20132 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SDSP20132 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SDSP20132 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SDSP20132 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SDSP20132 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SDSP20132 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SDSP20132 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SDSP20132 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SDSP20132 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SDSP20132 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SDSP20132 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SDSP20132 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SDSP20132 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDSP20132 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDSP20132 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDSP20132 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDSP20132 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDSP20132 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDSP20132 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SDSP20132 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDSP20132 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDSP20132 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDSP20132 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDSP20132 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SDSP20132 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDSP20132 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDSP20132 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDSP20132 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDSP20132 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDSP20132 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDSP20132 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDSP20132 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SDSP20132 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SDSP20132 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SDSP20132 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SDSP20132 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SDSP20132 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SDSP20132 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SDSP20132 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDSP20132 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDSP20132 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDSP20132 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDSP20132 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SDSP20132 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDSP20132 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDSP20132 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDSP20132 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDSP20132 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDSP20132 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SDSP20132 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
SDSP20132 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SDSP20132 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SDSP20132 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SDSP20132 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SDSP20132 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SDSP20132 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDSP20132 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDSP20132 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SDSP20132 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDSP20132 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDSP20132 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDSP20132 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SDSP20132 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SDSP20132 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SDSP20132 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SDSP20132 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SDSP20132 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SDSP20132 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SDSP20132 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SDSP20132 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SDSP20132 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SDSP20132 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SDSP20132 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SDSP20132 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SDSP20132 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SDSP20132 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SDSP20132 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SDSP20132 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SDSP20132 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SDSP20132 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SDSP20132 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SDSP20132 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SDSP20132 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SDSP20132 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SDSP20132 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDSP20132 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDSP20132 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDSP20132 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDSP20132 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SDSP20132 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SDSP20132 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SDSP20132 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SDSP20132 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms