Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRAP19793 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRAP19793 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRAP19793 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RXRAP19793 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRAP19793 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRAP19793 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRAP19793 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RXRAP19793 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRAP19793 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRAP19793 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRAP19793 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RXRAP19793 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RXRAP19793 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RXRAP19793 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RXRAP19793 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RXRAP19793 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RXRAP19793 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RXRAP19793 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RXRAP19793 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RXRAP19793 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RXRAP19793 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RXRAP19793 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RXRAP19793 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RXRAP19793 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RXRAP19793 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RXRAP19793 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RXRAP19793 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RXRAP19793 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RXRAP19793 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RXRAP19793 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RXRAP19793 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RXRAP19793 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RXRAP19793 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RXRAP19793 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RXRAP19793 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RXRAP19793 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RXRAP19793 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RXRAP19793 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RXRAP19793 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RXRAP19793 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RXRAP19793 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RXRAP19793 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RXRAP19793 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RXRAP19793 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RXRAP19793 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RXRAP19793 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RXRAP19793 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RXRAP19793 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RXRAP19793 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RXRAP19793 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RXRAP19793 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RXRAP19793 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RXRAP19793 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RXRAP19793 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RXRAP19793 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RXRAP19793 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RXRAP19793 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RXRAP19793 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RXRAP19793 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RXRAP19793 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RXRAP19793 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RXRAP19793 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RXRAP19793 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RXRAP19793 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RXRAP19793 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RXRAP19793 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RXRAP19793 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RXRAP19793 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RXRAP19793 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRAP19793 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRAP19793 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRAP19793 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRAP19793 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRAP19793 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRAP19793 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRAP19793 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RXRAP19793 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RXRAP19793 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RXRAP19793 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RXRAP19793 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RXRAP19793 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms