Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJB1P08034 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJB1P08034 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJB1P08034 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJB1P08034 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB1P08034 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB1P08034 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJB1P08034 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJB1P08034 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJB1P08034 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB1P08034 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB1P08034 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB1P08034 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB1P08034 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB1P08034 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB1P08034 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB1P08034 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB1P08034 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB1P08034 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB1P08034 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB1P08034 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB1P08034 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB1P08034 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB1P08034 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB1P08034 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB1P08034 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB1P08034 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB1P08034 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJB1P08034 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB1P08034 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB1P08034 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB1P08034 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB1P08034 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB1P08034 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB1P08034 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GJB1P08034 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB1P08034 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB1P08034 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB1P08034 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB1P08034 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB1P08034 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GJB1P08034 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GJB1P08034 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB1P08034 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB1P08034 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GJB1P08034 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB1P08034 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GJB1P08034 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB1P08034 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB1P08034 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJB1P08034 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB1P08034 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB1P08034 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB1P08034 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB1P08034 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB1P08034 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB1P08034 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJB1P08034 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB1P08034 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB1P08034 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB1P08034 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB1P08034 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB1P08034 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB1P08034 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJB1P08034 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GJB1P08034 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB1P08034 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB1P08034 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB1P08034 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB1P08034 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB1P08034 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB1P08034 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB1P08034 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GJB1P08034 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB1P08034 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB1P08034 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB1P08034 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB1P08034 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB1P08034 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJB1P08034 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB1P08034 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB1P08034 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB1P08034 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB1P08034 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB1P08034 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJB1P08034 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB1P08034 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB1P08034 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB1P08034 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB1P08034 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB1P08034 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJB1P08034 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB1P08034 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB1P08034 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB1P08034 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJB1P08034 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB1P08034 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB1P08034 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB1P08034 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GJB1P08034 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms