Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAVP06756 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGAVP06756 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGAVP06756 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms