Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGN2P05204 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGN2P05204 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMGN2P05204 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMGN2P05204 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms