Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZBED1O96006 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZBED1O96006 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ZBED1O96006 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZBED1O96006 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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