Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMCC1O94876 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMCC1O94876 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMCC1O94876 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMCC1O94876 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms