Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM4AO75164 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM4AO75164 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM4AO75164 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM4AO75164 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms