Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
IGSF3O75054 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
IGSF3O75054 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
IGSF3O75054 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IGSF3O75054 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms